A Common Rail rendszer működése abban különbözik más rendszerek működésétől, hogy az üzemenyag adagolásáról leválasztották a nyomás létrehozását. Így az üzemanyag befecskendezési nyomása a motor fordulatszámától függetlenül, egy nagynyomású szivattyú által külön szabályozható.

A Common Rail rendszer működése közben az üzemanyag a Common Rail csőbe kerül, ahol magas nyomás alatt van és innen kerül a porlasztókhoz. A porlasztócsúcsokat egy elektronikus motor-vezérlőegység kezeli, ez szabályozza a megfelelő üzemanyagmennyiség befecskendezését az égéstérbe.

A mükődés egyik alapfeltétele az a nagynyomású szivattyú, ami a Common Rail csőben megfelelő nyomáson tartja a befecskendezni kívánt üzemanyagot. Ez a nagynyomású szivattyú felelős azért, hogy a motor fordulatszámától függetlenül is megmaradjon a nyomás a Common Rail rendszerben.